Николаевский Малицкий мужской монастырь основан в конце XVI столетия в период царствования государя Федора Михайловича. Обитель расположилась на пустоши среди высокого соснового леса поблизости от реки Малица. Монахи, собравшиеся в этом монастыре, жили безмятежно, но довольно бедно – обитель была на отшибе, поэтому гости редко посещали ее.
В 1675 году страшный пожар уничтожил практически все постройки, возведенные трудолюбивыми братьями. Но в сильном огне чудом уцелела икона святителя Николая Чудотворца. Об этом событии вскоре узнали по всей Тверской земле, и на пепелище потянулись верующие люди со всей округи, чтобы воочию увидеть нетронутый огнем лик святителя.
Среди желающих увидеть чудесную икону были не только бедные, но и весьма обеспеченные верующие. В частности, Григорий Овцын, побывав на месте происшествия, пожаловал на восстановление монастыря немалые денежные средства. За эти деньги на месте сгоревших деревянных построек вскоре отстроили каменный пятиглавый храм, освященный в честь Всемилостивого Спаса. Затем были восстановлены кельи, и в обители возобновилась жизнь на многие десятилетия.
Второй раз Николаевский Малицкий монастырь был полностью разрушен осенью 1941 года в результате военных действий. После окончания войны монахам не разрешили отстроить обитель. Сохранившиеся руины передали колхозу, а затем и вовсе разобрали для строительства нового жилья.
Только в 2005 году начались работы по обустройству обители на ее прежнем месте. На первых порах была благоустроена территория монастыря, отстроены братский корпус, трапезная, домовой храм, звонница и подсобные помещения.
В настоящее время, помимо упомянутых выше строений, на территории Николаевского Малицкого монастыря расположены Покровский и Спасский храмы, часовня, церковь преподобного Петра Афонского.