Более четырех веков Кенигсберг оставался сугубо протестантским городом, в котором католическая община чувствовала себя не очень уютно. У католиков не было святыни, в которой они могли бы удовлетворить свои духовные потребности. Ситуация изменилась только к началу ХХ столетия, когда в престижном районе Амалиенау, рядом с церковью памяти королевы Луизы, городские власти разрешили построить католическую капеллу. Новую святыню освятили в 1902 году. Правда, она была настолько маленькой, что не могла поместить всех кенигсбергских католиков.
В начале 30-х годов здание перестроили, значительно расширив его – теперь здесь могло одновременно вместиться 250 прихожан. Повысился и статус капеллы – она стала кирхой Святого Адальберта, покровителя Пруссии.
При штурме города советскими войсками в апреле 1944 года постройка сильно пострадала, однако долгие годы никто не обращал на нее внимания. Только в 1975 году реконструкция коснулась и этого исторического объекта. Строители разделили внутреннее пространство кирхи на этажи, установив дополнительные перекрытия, укоротили башню, прорезали новые проемы для окон, а вход перенесли на торцевую стену. Интерьеры кирхи в процессе таких усовершенствований были полностью уничтожены.
Обновленную постройку передали в пользование администрации Института земного магнетизма РАН. На балансе этого научного учреждения бывшая кирха состоит до сих пор.
