Церковь Спаса Преображения на Городу на набережной реки Которосли построили в 1672 году на месте бывшего деревянного храма под таким же названием, который впервые упоминается в летописях за XIII век. Средства на строительство святыни пожертвовал ярославский купец И. Кислов. Внешне церковь очень похожа на Иоаннозлатоустовский храм в Коровниках, который и послужил образцом для строительства. Сооружение поражает своими массивными пятью главами и убранством северного фасада. На момент строительства северная сторона церкви выходила на торговую площадь, чем и объясняется такое великолепие.
В 1693 году буквально за полтора месяцы артель художников под руководством Федора Федорова и Лаврентия Севастьянова расписала внутренние стены. К сожалению, не все фрески сохранились на века – первые росписи пострадали еще во время реставрационных работ во второй половине XIX столетия.
В 1831 году с южной стороны здания перестроили теплый Никольский придел, который в наши дни носит название в честь Серафима Саровского. Тогда же к церкви пристроили крыльцо.
В ходе Гражданской войны церковь Спаса на Городу была сильно повреждена. Здание отреставрировали к 1920 году, но вскоре советские власти упразднили храм. Долгое время в постройке располагались склады, что не пошло на пользу внутреннему убранству святыни. Затем сооружение перешло под опеку Ярославского музея-заповедника.
В августе 2003 года мелодичный звон колоколов после долгих лет молчания снова раздался над церковью Спаса. С тех пор здесь постоянно ведутся богослужения, которые осуществляются в южном приделе.
