В исторических документах нет согласия по поводу того, когда же был создан Вознесенский монастырь. Одни источники утверждают, что такое событие состоялось в 1515 году, другие, что в 1630. Достоверно известно только то, что до конца XVII столетия все постройки обители были деревянными.
В 1693 году в Смоленск прибыл зодчий Осип Старцев с готовыми чертежами для постройки главного монастырского собора. Строительство продолжалось до 1704 года. Новый храм получил то же название, что и монастырь. Во внешнем облике собора просматривалась строгость петровских времен, однако белокаменное здание великолепно смотрелось на фоне окружающих его служебных построек.
В 1764-1765 годах, когда игуменьей была Олимпиада Рыдванская, к собору с северо-восточной стороны пристроили Екатерининский придел. А еще через какое-то время обитель отгородили каменной оградой.
Во время французско-российской войны 1812 года монастырь был разорен войсками Наполеона. В жилых помещениях расквартировались солдаты, а храмы превратились в конюшни. После освобождения Смоленска обитель восстановили. В начале 30-х годов XIX столетия комплекс монастырских сооружений пополнила Ахтырская церковь.
Большевики после прихода к власти не стали разрушать здания Вознесенского монастыря, разместив здесь клуб работников типографии имени Смирнова, а вот уникальному иконостасу в стиле барокко не поздоровилось – его полностью уничтожили. Что не сделали представители советской власти, то за них сделала Великая Отечественная война. К реставрации святынь приступили только в конце 60-х годов, но восстановленный Вознесенский собор стали использовать в качестве выставочного зала. В других постройках обители разместились различные городские организации.
В настоящее время в Вознесенском соборе ведется реставрация, после завершения которых он будет передан под опеку монахиням Вознесенского монастыря.