Крутицами в былые времена называли все возвышенности на левом берегу Москва-реки. Отсюда пошло и название Крутицкого монастыря, основанного в XIII столетии князем Даниилом Московским. Обитель росла вокруг Успенского храма – главной святыни монастыря.
Территория, которую ныне называют Патриаршим Подворьем, тот облик, в каком видим ее сегодня, получила во второй половине XVII века при митрополите Павле ІІ. Тогда к храмам и зданиям монастыря добавилось главное украшение обители – Святые врата с надвратным теремком, а также был высажен «Крутицкий вертоград» – один из первых московских декоративных садов.
В конце XVIII столетия Крутицкую епархию упразднили, Успенский храм объявили обыкновенной приходской церковью, а Подворье передали под военные казармы. Окончательно богослужения прекратились здесь в 1924 году, когда всю территорию бывшего Крутицкого монастыря отдали под контроль военных ведомств.
Новую жизнь Крутицкое Подворье стало обретать с 1947 года, когда под руководством известного советского архитектора Петра Барановского начались реставрационные работы. Через двадцать лет уникальный архитектурный комплекс признали музейным объектом, а с 1982 года Подворье стало филиалом Исторического музея.
В 1991 году часть зданий вернули Русской Православной Церкви. Тогда же Крутицы стали официальным Подворьем Патриарха Московского и Всея Руси. В наши дни там располагается отдел по делам молодежи РПЦ.