У краковской базилики Святой Троицы длинная и насыщенная история. Первый храм с таким названием в городе возвели и освятили в 1223 году монахи-доминиканцы, прибывшие в Краков из Болоньи. Собор уничтожили татаро-монголы во время одного из нашествий.
В 1241 на его месте построили готическую базилику, которая сильно пострадала от пожара в 1850 году. Практически сразу после трагического происшествия начались восстановительные работы. Строители разобрали часть обгоревших несущих стен, а для удержания нового свода придумали специальные деревянные подпорки. Но когда в 1855 году для того, чтобы установить в храме новые витражи, пришлось убрать часть подпорок, неожиданно обрушилась часть стен и свода. Пришлось начинать реконструкцию заново.
Окончательно храм перестроили к 1884 году. По мнению общественности и старожилов, помнящих первозданный вид здания, реставрация получилась неудачной, а архитектора, руководившего работами, подвергли жесткой критике. Однако изменить что-либо было уже невозможно.
С тех пор базилика Святой Троицы является важным религиозным центром Польши. В храме издавна хранится чудотворный образ Матери Божьей Розария, обладающий целебной силой. Ради этой иконы в церковь приходят тысячи паломников со всего мира, чтобы взглянуть на святыню, прикоснуться к ней и вымолить себе Божье милосердие.