Флорентийский Музей естественной истории является подразделением местного университета и состоит из шести отдельных коллекций: палеонтологии, антропологии, минералогии, ботаники, биологии и зоологии.
Музей основан в 1775 году по инициативе Великого Герцога Тосканского Пьетро Леопольдо. Изначально он назывался «Королевский музей физики и естественной истории» и занимал свободные площади в Палаццо Торриджани. Однако на протяжении всей своей истории музей неоднократно расширялся, и в наши дни является одним из ведущих культурных заведений не только в Италии, но и во всем мире.
При входе в здание посетителей встречают макеты огромных динозавров в натуральную величину.
В заведении собран уникальный гербарий, насчитывающий более 4 миллионов экспонатов; в отделении минералогии хранится более 50 тысяч различных камней и минералов; в зоолологическом отделении собрано 3 миллиона экспонатов, но к обозрению выставлены только 5 тысяч артефактов. Заслуживают внимания и антропологические коллекции, в которых, в частности, представлены экспонаты, собранные Джеймсом Куком во время его экспедиций к островам в Тихом океане.
Поскольку музей является подразделением университета, для свободного посещения он открыт только в первой половине дня с 9 до 13 часов.
При музее функционирует Ботанический сад, разбитый в первой половине XVI столетия. На сегодняшний день его коллекция состоит из 9 тысяч растений.