Идея основать Синий музей появилась в 2004 году, когда здание использовалось в качестве места для обсуждения проблем культуры. К 2011 году его существенно переоборудовали и оно стало 4-й секцией, вошедшей в уже давно существующий музей естествознания в Барселоне. Его главная тематика — натуральные науки, цель — знакомство с историей развития планеты. Благодаря аудиовизуальному оборудованию, обновленный сегмент призван сделать пребывание посетителей более увлекательным. Техника помогает интерактивно влиять на ход экскурсии и получать информацию на электронных стендах.
Объект вмещает многообразие малых и огромных экспонатов, которые хранятся в эффектном здании треугольной формы. 17 опор также возносят музей над землей, создавая эффект парения. Внутри доступны к обозрению 3 крупных выставки: первая — о текущем состоянии Земли, вторая — об эволюционном процессе, последняя — о водном мире средиземноморья. Часть экземпляров размещены под стеклом, но много и тех, которые можно беспрепятственно потрогать. На входе величественно располагается копия кита в полную длину.
Есть чучела животных, редкие камни и глубинные породы. В 2000 году в музей включили Ботанический сад, который располагается на горе Монжуик. Билеты в Синий музей часто продаются вместе с этой экскурсией, в ходе которой на 14-гектарном участке можно обнаружить около четверти всех существующих на планете растений.